Lag eine stark infizierte Fistelbildung vor, ist in jedem Falle die sekundäre Wundheilung (offene Wundheilung) anzustreben. Nach der Fistelexcision (dem Ausschneiden der Fistel) und Abschabung der Knochenhaut wird in diesem Fall eine Tamponade mit Jod oder Tannin eingelegt. 24 Stunden nach der Operation folgen täglich Sitzbäder und das Entfernen der Tamponade, bis die vollständige Wundheilung abgeschlossen ist. Die radikale Entfernung der Steißbeinfistel und sämtlicher Fistelgänge mit anschließender offener Heilung erfordert einen langen Heilungsprozess. Da es sich um eine tiefe Wunde handelt, die meistens bis auf den Knochen des Steißbeins geht, heilt sie nur langsam von unten nach oben. Der Patient sollte sich auf eine Heilungsdauer von möglicherweise mehreren Monaten einstellen.
Die Arbeitsunfähigkeit beträgt je nach beruflicher Belastung 3-4 Wochen. Generell kann der Patient sich nach der Operation alles zumuten, was nicht schmerzhaft ist. Wichtig ist, in der Zeit nach der OP verstärkt auf eine gute Körperhygiene zu achten. Dies ist notwendig, damit sich die Wunde nicht entzündet und Rezidiven (= Rückfällen) vorgebeugt wird. Die Gesäßfalte ist ein sogenannter intertriginöser Bereich. Das bedeutet, dass Haut auf Haut liegt und wenig Luft an diesen Bereich kommt. Hier sammelt sich beim Sport schnell Schweiß. Außerdem können die beiden gegenüberliegenden Hautflächen durch den ständigen Kontakt zueinander bei stärkerer Bewegung wundgescheuert werden. All dies sind keine guten Bedingungen für die Heilung einer Wunde. Daher sollte Sport frühestens dann getrieben werden, wenn die Operationswunde komplett abgeheilt ist. Keinen Sport treiben zu dürfen, bedeutet allerdings nicht, sich gar nicht bewegen zu dürfen. Alle leichten Bewegungen, die nicht schmerzen, sollten gemacht werden. Die Wundränder müssen sich an die Anforderungen des Alltags anpassen, daher wäre z.B. komplette Bettruhe nicht hilfreich, die Wunde könnte eventuell zu eng verheilen und die Narbe wäre gefährdet, zu reißen. Daher ist baldige leichte Bewegung nach einer Steißbeinfistel-Operation empfehlenswert, dabei darf nur auf keinen Fall übertrieben werden. Auch wenn es nach einer Fistel-Operation theoretisch nach einiger Zeit wieder möglich ist, längere Zeit am Stück zu sitzen, so sollte dies wenn irgendwie möglich nicht praktiziert werden. Langes Sitzen begünstigt ohnehin das Auftreten von Fisteln, in der Zeit nach einer Steißbeinfistel-Operation ist dieses Risiko aber noch einmal erhöht.