In seltenen Fällen, wenn Blutgefäße eingeengt, verschlossen oder brüchig sind, gelingt es nicht, den Katheter einzuführen. Der Eingriff muss dann ohne die Implantation des Ports abgebrochen werden.
Trotz größter Sorgfalt kann es bei der Implantation eines Portsystems zu unerwünschten Ereignisse kommen. Schwere und lebensgefährliche Komplikationen sind dabei außerordentlich selten. Neben den für alle Operationen möglichen allgemeinen Komplikationen wie Blutungen, Infektionen und Thrombosen, sind bei allen genannten operativen Verfahren Schwellungen und leichte Schmerzen im OP-Bereich, bedingt durch Blutergüsse oder Gewebewasseransammlungen möglich. In aller Regel verschwinden diese Beschwerden in kurzer Zeit. Bei der Punktion der Schlüsselbeinvene kann in seltenen Fällen das Rippenfell verletzt werden. Hierdurch kann Luft in den Brustraum eindringen und ein sogenannter Pneumothorax auftreten, welcher unter Umständen eine Behandlung im Krankenhaus erfordert.